NMPFamsDB

NMPFamsDB

NMPFamsDB

A database of Novel Metagenome Protein Families

A database of Novel Metagenome Protein Clusters

A database of Novel Metagenome Protein Clusters
x
This website uses cookies to improve user experience. By using NMPFamDB you consent to all cookies in accordance with our privacy policy. OK
Metagenome Family F089090

Metagenome Family F089090

Go to section:
Overview Alignments Structure & Topology Gene Neighborhood Phylogeny Ecosystems Sequences
Select file to download:
   Download


Overview

Basic Information
Family ID F089090
Family Type Metagenome
Number of Sequences 109
Average Sequence Length 127 residues
Representative Sequence MTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARVVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Number of Associated Samples 74
Number of Associated Scaffolds 109

Quality Assessment
Transcriptomic Evidence No
Most common taxonomic group Bacteria
% of genes with valid RBS motifs 65.14 %
% of genes near scaffold ends (potentially truncated) 35.78 %
% of genes from short scaffolds (< 2000 bps) 85.32 %
Associated GOLD sequencing projects 58
AlphaFold2 3D model prediction No

Note: High quality evidence is represented by blue. Low quality evidence is represented by red.
Hidden Markov Model
Powered by Skylign

Most Common Taxonomy
Group Bacteria (60.550 % of family members)
NCBI Taxonomy ID 2
Taxonomy All Organisms → cellular organisms → Bacteria

Most Common Ecosystem
GOLD Ecosystem Host-Associated → Plants → Rhizosphere → Soil → Unclassified → Corn Rhizosphere
(20.183 % of family members)
Environment Ontology (ENVO) Unclassified
(71.560 % of family members)
Earth Microbiome Project Ontology (EMPO) Host-associated → Plant → Plant rhizosphere
(82.569 % of family members)



 ⦗Top⦘

Multiple Sequence Alignments

Select alignment to view:      
Full Alignment
Alignment of all the sequences in the family.
Sorting
Filter
Selection
Vis.elements
Color scheme
Extras
Export
Help

IDLabel
.2.4.6.8.10.12.14.16.18.20.22.24.26.28.30.32.34.36.38.40.42.44.46.48.50.52.54.56.58.60.62.64.66.68.70.72.74.76.78.80.82.84.86.88.90.92.94.96.98.100.102.104.106.108.110.112.114.116.118.120.122.124.126.128.130.132.134.136.138.140.142.144.146.148.150.152.154.156.158.160.162.164.166.168.170.172.174.176.178.180.182
1C688J35102_1178510791
2Ga0062595_1018445151
3Ga0070658_101158303
4Ga0070658_102163802
5Ga0070676_100422312
6Ga0070676_105713091
7Ga0070670_1000252864
8Ga0070670_1000527684
9Ga0070670_1003993641
10Ga0070677_100814802
11Ga0070677_101344852
12Ga0068869_1006138572
13Ga0070680_1017921431
14Ga0070682_1006609122
15Ga0068868_1004977752
16Ga0068868_1014588132
17Ga0070660_1006434612
18Ga0070660_1013483751
19Ga0070661_1002926592
20Ga0070661_1006978182
21Ga0070692_108997962
22Ga0070668_1008188581
23Ga0070675_1001803642
24Ga0070673_1003761451
25Ga0070659_1009895701
26Ga0070659_1010124012
27Ga0070667_1005362521
28Ga0070711_1006122581
29Ga0070700_1012457982
30Ga0070663_1013323672
31Ga0070678_1001950402
32Ga0070678_1017152931
33Ga0070662_1004800482
34Ga0070679_1010695252
35Ga0070672_1001816232
36Ga0070693_1002302042
37Ga0068852_1002259432
38Ga0068852_1004718692
39Ga0068852_1009310462
40Ga0068864_1002326791
41Ga0068870_104581841
42Ga0066651_105813592
43Ga0066652_1011059312
44Ga0097621_1001064324
45Ga0068871_1016934432
46Ga0111538_138864891
47Ga0105248_112321881
48Ga0126305_109325802
49Ga0150985_1187401331
50Ga0157371_109596802
51Ga0157370_103098981
52Ga0157369_108604431
53Ga0157374_100250274
54Ga0157372_103611242
55Ga0134079_102015121
56Ga0163163_121322811
57Ga0157377_100504312
58Ga0157379_109448602
59Ga0157379_123373682
60Ga0132258_106445384
61Ga0247794_100493512
62Ga0207656_100502312
63Ga0207656_100516392
64Ga0207656_100538802
65Ga0207656_101536221
66Ga0207682_101799351
67Ga0207688_100525533
68Ga0207643_105402271
69Ga0207705_114850531
70Ga0207657_104884872
71Ga0207649_103854942
72Ga0207649_107171682
73Ga0207650_101262293
74Ga0207650_103705981
75Ga0207650_110799032
76Ga0207644_109535341
77Ga0207644_117446301
78Ga0207690_101447312
79Ga0207690_104565452
80Ga0207706_102229832
81Ga0207706_105853562
82Ga0207706_107874742
83Ga0207669_105839131
84Ga0207689_110496711
85Ga0207679_103843252
86Ga0207679_106987102
87Ga0207668_121373852
88Ga0207640_100748974
89Ga0207677_111693291
90Ga0207677_113953732
91Ga0207678_102953262
92Ga0207708_113847241
93Ga0207702_106749352
94Ga0207641_102933372
95Ga0207683_100063387
96Ga0207698_108659272
97Ga0207698_111991781
98Ga0308174_100080262
99Ga0308174_100505992
100Ga0308174_102736042
101Ga0308174_109444021
102Ga0308174_111097911
103Ga0308176_112052612
104Ga0308173_100412564
105Ga0308173_100570051
106Ga0308173_100785931
107Ga0308173_102965393
108Ga0308173_104935491
109Ga0308173_107613672
Powered by MSAViewer


 ⦗Top⦘

Structure & Topology

Predicted Secondary Structure and Topology

Predicted Topology & Secondary Structure
Classification: Globular Signal Peptide: No Secondary Structure distribution: α-helix: 48.03%    β-sheet: 12.60%    Coil/Unstructured: 39.37%
Feature Viewer
Position :
0
Zoom :
x 1
+ Add Multiple Variants

Enter the variants

Position

Original

Variant

Get Predictions
Get Predictions

Enter the variants

Position

Original

Variant

102030405060708090100110120MTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARVVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDNDSequenceα-helicesβ-strandsCoilSS Conf. score
Powered by Feature Viewer


 ⦗Top⦘

Gene Neighborhood

Neighboring Pfam domains


Neighboring Clusters of Orthologous Genes (COGs)



 ⦗Top⦘

Phylogeny

NCBI Taxonomy

Select NCBI taxonomy Level:

Visualization
All Organisms
Unclassified
60.6%39.4%
Download SVG
Download PNG
Download CSV
Powered by ApexCharts

Associated Scaffolds





 ⦗Top⦘

Environmental Properties

Associated Habitat Types

Select Environment Taxonomy Level:

Visualization
Serpentine Soil
Grasslands Soil
Soil
Soil
Soil
Soil
Soil
Corn, Switchgrass And Miscanthus Rhizosphere
Corn Rhizosphere
Arabidopsis Rhizosphere
Avena Fatua Rhizosphere
Corn Rhizosphere
Switchgrass Rhizosphere
Miscanthus Rhizosphere
Corn, Switchgrass And Miscanthus Rhizosphere
Miscanthus Rhizosphere
Miscanthus Rhizosphere
Switchgrass Rhizosphere
Populus Rhizosphere
Switchgrass Rhizosphere
Corn Rhizosphere
Miscanthus Rhizosphere
Switchgrass Rhizosphere
Switchgrass Rhizosphere
Miscanthus Rhizosphere
Corn Rhizosphere
11.0%4.6%10.1%7.3%3.7%11.0%7.3%20.2%
Download SVG
Download PNG
Download CSV
Powered by ApexCharts



Associated Samples


Geographical Distribution
Zoom:     Powered by OpenStreetMap



 ⦗Top⦘

Family Sequences

Protein ID Sample Taxon ID Habitat Sequence
C688J35102_11785107913300002568SoilMDPFVVAAFKQRAAAEDAVERVRSSGLATREIRVETAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNELFDHRADERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDSANEVQALLTAAGAERVSVLPQAGLDTD*
Ga0062595_10184451513300004479SoilMSPFVVAAFKQRAAAEDAVERLRSSGLATREVRVETAPDVINAASIEADEMATGGFFGNAARLLNDLFDHRADERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDEANQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLDSD*
Ga0070658_1011583033300005327Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLKSSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070658_1021638023300005327Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0070676_1004223123300005328Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRGSGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070676_1057130913300005328Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDEHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070670_10002528643300005331Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFNDRAAADAAVERLRTSGPPAREIRVESAPDVINAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNELFDHPTDERYAVDYDDLVHKEARVVTVVLNSSGSAKEVADLLRAAGARRVSALPQPGLDAD*
Ga0070670_10005276843300005331Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070670_10039936413300005331Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070677_1008148023300005333Miscanthus RhizosphereMTPFVVSAFNDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070677_1013448523300005333Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0068869_10061385723300005334Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDERHAVDYDDMVRKEARVVTVVLESGDSAQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070680_10179214313300005336Corn RhizosphereGPPTREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0070682_10066091223300005337Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVERLRASGPPTREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0068868_10049777523300005338Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSEEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0068868_10145881323300005338Miscanthus RhizosphereFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070660_10064346123300005339Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDNRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070660_10134837513300005339Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAA
Ga0070661_10029265923300005344Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPVAADAAVERLRTSGAPMREVRVDTAPDVQNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDDRHAVDYDDMVHKQARVVTVVLDSKDSAQEVVELLTAAGADRVSALPQPGLDSD*
Ga0070661_10069781823300005344Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070692_1089979623300005345Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereAADAAVERLRTSGAPMREVRVDTAPDVQNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELFDYRPDDRHAVDYDDMVHKQARVVTVVLDSKDSAREVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070668_10081885813300005347Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSA
Ga0070675_10018036423300005354Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070673_10037614513300005364Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSKDSAQEVVELLTAAGADRVSALPQPGLD
Ga0070659_10098957013300005366Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDN
Ga0070659_10101240123300005366Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRTGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0070667_10053625213300005367Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDRAAADAAVERLRASGPSAREIRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDERHAVDYDDMVRKEARVVTVVLESGDSAQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070711_10061225813300005439Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereRAAAEDAVERLRSSGIATREIRVETAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNELFDHRADERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDAANQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLDGD*
Ga0070700_10124579823300005441Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARVVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070663_10133236723300005455Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQDVADLLAA
Ga0070678_10019504023300005456Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0070678_10171529313300005456Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFNDRAAADAAVERLRTSGPPAREIRVESAPDVINAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNELFDHPTDERYAVDYDDLVHKEARVVTVVLNSSDSAKEVADLLTAAGARRVSALPQPGLDAD*
Ga0070662_10048004823300005457Corn RhizospherePAERTPALFPETAMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERQAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070679_10106952523300005530Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPVAADAAVERLRTSGAPMREVRVDTAPDVQNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0070672_10018162323300005543Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERQAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0070693_10023020423300005547Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVERLRASGPPTREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHRPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0068852_10022594323300005616Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVERLRASGPPTREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHRPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLGPGESAKDVVDMLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0068852_10047186923300005616Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDLAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0068852_10093104623300005616Corn RhizosphereMTPFVVAAFRDSSAADAAVERLRTSGPSAREIRVHTAPDVMNAASIEVDEIATGGFFGNAARLLVDLLGSPPDDRHALDYNDMAHKEARVVTVVLDSTDAAQQVAELLTTAGAERVSALPQPGLDNG*
Ga0068864_10023267913300005618Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVMLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0068870_1045818413300005840Miscanthus RhizospherePMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0066651_1058135923300006031SoilMDPFVVAAFKQRAAAEDAVERVRSSGIATREIRVDTAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNDLFDHRTDERLAVDYDDLAHREARVVTVVLDSRDSARQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLVDD*
Ga0066652_10110593123300006046SoilMSPFVVAAFKQRAAAEDAVERLRSSGLATREVRVETAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNELFDHRADERLAVDYDDLAHKEVRVVTVVLDSRDVARQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLDSD*
Ga0097621_10010643243300006237Miscanthus RhizosphereVVPALEPPIRTRWVATGDRRGGDGRARVMPVIGRLNVPVGVPMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0068871_10169344323300006358Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSTLPQPGLGND*
Ga0111538_1388648913300009156Populus RhizosphereMTPFVVAAFKDRAVADAAVERLRTSGPPTREIRVDTAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0105248_1123218813300009177Switchgrass RhizosphereDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSEEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0126305_1093258023300010036Serpentine SoilMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPPTREIRVDTAPDVLNAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLFDYPADDRQAVDYNDMARKEARVVTVVLDSGDSASEVADLLTAA
Ga0150985_11874013313300012212Avena Fatua RhizosphereMTPFVVAAFRDSSVADAAIERLRTAGPSTREIRVQTAPDVLNANTIEADEIATGGFFGNAARLLVDLFGTPPDDRHALDYNDMAHKEARVVTVVLDSTDAAQQVAELLTAAGADRVSALPQPGLDNG*
Ga0157371_1095968023300013102Corn RhizosphereVAADAAVERLRTSGAPMREVRVDTAPDVQNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHRPDDRHAVDYDDMVHKEARVVTVVLDSKDSAQEVVELLTAAGADRVSALPQPGLDSD*
Ga0157370_1030989813300013104Corn RhizosphereDAAVERLRAGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHRPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0157369_1086044313300013105Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPVAADAAVERLRASGPPTREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHRPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLGPGESAKDVVDMLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0157374_1002502743300013296Miscanthus RhizosphereMPVIGRLNVPVGVPMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVMLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0157372_1036112423300013307Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPTREVRVDSAPDVLDAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD*
Ga0134079_1020151213300014166Grasslands SoilMDPFVVAAFKQRAAAEDAVERVRSSGIATREIRVDTAPDVINAATIEADEMVTGGFFGNAARLLNDLFDHRTDERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDSARQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLVDD*
Ga0163163_1213228113300014325Switchgrass RhizosphereAPCRQAHIHYIAAGDPMTPFVVAAFNDRAAADAAVERLRTSGPPAREIRVESAPDVINAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNELFDHPTDERHAVDYDDLVHKEARVVTVVLNSSDSAKEVADLLTAAGARRVSALPQPGLDAD*
Ga0157377_1005043123300014745Miscanthus RhizosphereMPVIGRLNVPVGVPMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARVVTVVLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0157379_1094486023300014968Switchgrass RhizosphereMPVIGRLNVPVGVPMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0157379_1233736823300014968Switchgrass RhizosphereADAAVERLRASGPSAREIRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDERHAVDYDDMVRKEARVVTVVLESGDSAQEGVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0132258_1064453843300015371Arabidopsis RhizosphereMTPFVVAAFKDRAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDERHAVDYDDMVRKEARVVTVVLESADSAQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND*
Ga0247794_1004935123300024055SoilMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD
Ga0207656_1005023123300025321Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPTREVRVDSAPDVLNAAAIEVDEMATGGFLGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD
Ga0207656_1005163923300025321Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207656_1005388023300025321Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRAAADAAVERLRASGPSAREIRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDERHAVDYDDMVRKEARVVTVVLESGDSAQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207656_1015362213300025321Corn RhizosphereRLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207682_1017993513300025893Miscanthus RhizosphereTAMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207688_1005255333300025901Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207643_1054022713300025908Miscanthus RhizosphereAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDN
Ga0207705_1148505313300025909Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGL
Ga0207657_1048848723300025919Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRAGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207649_1038549423300025920Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207649_1071716823300025920Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPVAADAAVERLRTSGAPMREVRVDTAPDVQNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGYRPDDRHAVDYDDMVHKQARVVTVVLDSKDSAQEVVELLTAAGADRVSALPQPGLDSD
Ga0207650_1012622933300025925Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFNDRAAADAAVERLRTSGPPAREIRVESAPDVINAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNELFDHPTDERYAVDYDDLVHKEARVVTVVLNSSGSAKEVADLLTAAGARRVSALPQPGLDAD
Ga0207650_1037059813300025925Switchgrass RhizosphereQAARQPRVVPALEPPIRTRWVATGDRRGGDGRARVMPVIGRLNVPVGVPMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207650_1107990323300025925Switchgrass RhizosphereMTPSVVAVFRKRAAAEAAVERLRESGPPAREIRVETGADVLNAEAIEIDEMATGGFVGNAARLLNDLLGHRADERHAVDYDDLAHKEACVVTVVLDSAGSAAAVADRLTAAGADRVSALPQPGLDDD
Ga0207644_1095353413300025931Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREARVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207644_1174463013300025931Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFRDSSAADAAVERLRTSGPSAREIRVHTAPDVMNAASIEVDEIATGGFFGNAARLLVDLLGSPPDDRHALDYNDMAHKEARVVTVVLDSTDAAQQVAELLTTAGAERVSALPQPG
Ga0207690_1014473123300025932Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPVAADAAVERLRTGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD
Ga0207690_1045654523300025932Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVS
Ga0207706_1022298323300025933Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERQAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207706_1058535623300025933Corn RhizosphereRSQGAVQSMINRDPAATTSGTRRAGRGRPHDFPKTSMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207706_1078747423300025933Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRLAADAAVERLRTGGPPAREVRVDTAPDVLNAAAIEVDEMATGGFFGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVRKEARVVTVVLDPGESAKDVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDDD
Ga0207669_1058391313300025937Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLTASGADRVSALPQPGLDND
Ga0207689_1104967113300025942Miscanthus RhizosphereALFPETAMTPFVVAAFKDLAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207679_1038432523300025945Corn RhizosphereMTPFVVAAFNDRAAADAAVERLRTSGPPAREIRVESAPDVINAATIEVDEMASGGFFGNAARLLNELFDHPTDERYAVDYDDLVHKEARVVTVVLNSSDSAKEVADLLTAAGARRVSALPQPGLDAD
Ga0207679_1069871023300025945Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRGSGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDERHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRV
Ga0207668_1213738523300025972Switchgrass RhizosphereLFPETAMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207640_1007489743300025981Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAVRLLDELLGYRPDDQHAVDYDDMARKEARVVTVVLESGDSAQEVVDVLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207677_1116932913300026023Miscanthus RhizosphereMGTRPAGKRAPALFPETAMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207677_1139537323300026023Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVV
Ga0207678_1029532623300026067Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSSDAAQDVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207708_1138472413300026075Corn, Switchgrass And Miscanthus RhizosphereAATTSGTRRAGRGRPHDFPKTSMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGAIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARVVTVVLESSDSSQEVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207702_1067493523300026078Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAAAIEVDEMATGGFLGNAARLLDELLGHPPDDRHAVDYDDMVHKEARVVTVVLDSKDSAREVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDSD
Ga0207641_1029333723300026088Switchgrass RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVMLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207683_1000633873300026121Miscanthus RhizosphereMTPFVVAAFKDRVAADAAVEHLRRSGPPTREVRVDSAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARLVTVVLESSDSSQEVVDLLSAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0207698_1086592723300026142Corn RhizosphereMTPFVVAAFKDPAAADAAVERLRESGTTTREIRVETAPDVMNAASIEVDEMASGGFFGNAARLLNDLLGYRPDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSTDAAQEVADLLAAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0207698_1119917813300026142Corn RhizosphereMTPFVVAAFRDSSAADAAVERLRTSGPSAREIRVHTAPDVMNAASIEVDEIATGGFFGNAARLLVDLLGSPPDDRHALDYNDMAHKEARVVTVVLDSTDAAQ
Ga0308174_1000802623300031939SoilMDPFVVAAFKQRAAAEDAVERVRSSGIATREIRVDTAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNDLFDHRTDERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDSARQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLVDD
Ga0308174_1005059923300031939SoilMTPFVVAAFKDRAAADVAVERLRTSGPPTRGVRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLIDDLLGYRPDDRHAVDYDDLARKEAKVVTVMLESGDSAQQVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0308174_1027360423300031939SoilMTPFVVAAFKDRAAADAAVERLRTSGPSAREIRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLLDELFGHRPDDQHAVDYDDMVRKEARVVTVVLGPGDSAQQVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0308174_1094440213300031939SoilMTPFVVAAFKDRAAADAAAERLRTSGPPTREIRVDTAPDVLNAATIEVDEMATGGFFGNAARLLDELFDYRPDDRHAVDYDDLVRREARIVTVVLESGAAAKQVADFLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0308174_1110979113300031939SoilMTPFVVAVFRDSSAADAAVERLRASGVSTREIRVHTAPDVLNANTIEVDELATGGFFGNAARLLVDLLGSPPDDRHALDYNDMAHKAARVVTVVLDSTDAAQQVAELLTAAGAARVSALPQPGLDNG
Ga0308176_1120526123300031996SoilMTPFVVAAFSDLPAADAAVERLRSSGLPTREIRVETAPDVLNAASIEVDEMATGGFFGNAARLLNDLLGHPVDDRHAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSGDAAQEVVDLLSAAGAKRVSALPQPGLDND
Ga0308173_1004125643300032074SoilMDPFVVAAFKQRAAAEDAVERVRSSGIATREIRVDTAPDVINAATIEADEMATGGFFGNAARLLNDLFDHRTDERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDSARQVEALLTAA
Ga0308173_1005700513300032074SoilRAAAEDAVERVRSSGIATREIRVDTAPDVINAATIEADEMVTGGFFGNAARLLNDLFDHRTDERLAVDYDDLAHKEARVVTVVLDSRDSARQVEALLTAAGAERVSVLPQAGLVDD
Ga0308173_1007859313300032074SoilAADVAVERLRTSGPPTRGVRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLIDDLLGYRPDDRHAVDYDDLARKEAKVVTVMLESGDSAQQVVDLLTAAGADRVSALPQPGLDNG
Ga0308173_1029653933300032074SoilTPFVVAAFKDRAAADMAVERLRTSGPPTRGVRVDSAPDVLNAGTIEVDEMATGGFFGNAARLIDDLLGYRPDDRHAVDYDDLVRKEARIVTVVLESGDAAKQVADFLTAAGADRVSALPQPGLDND
Ga0308173_1049354913300032074SoilMTPFVVAVFRDSSAADAAVERLRASGVSTREIRVHTAPDVLNANTIEVDELATGGFFGNAARLLVDLLGSPPDDRHALDYNDMAHKAARVVTVVLDSTEAAQQVAELLTAAGAARVSALPQPGLDNG
Ga0308173_1076136723300032074SoilMTPFVVAAFNDPAAADAAVQRLRTSGPPTREIRVDTAPDVLNAAAIEVDEVATGGFFGNAARLLNELLGRPVDDRHAVDYDDLAQKEARVVTVVLDSGDAAQEVVDLLSAAGAKRVSALPQPGLDND


 ⦗Top⦘


© Pavlopoulos Lab, Bioinformatics & Integrative Biology | B.S.R.C. "Alexander Fleming" | Privacy Notice
Make sure JavaScript is enabled in your browser settings to achieve functionality.